A FDS, tem como órgão mantenedor a SESUP – SOCIEDADE DE EDUCAÇÃO DE ENSINO SUPERIOR, cuja Diretora Presidente é a Sra. Débora Antunes da Silva, assessorada de imediato pela Diretoria Administrativa e Financeira. Este é o órgão responsável pela estrutura física, pelo seu crescimento e pelo equilíbrio da gestão financeira.

A sua gestão é realizada através de órgãos administrativos e deliberativos. Como órgão administrativo básico ressalta-se a Direção Geral, responsável pelo gerenciamento do ensino, tendo como assessores imediatos a Direção Acadêmica, a Secretaria Geral, os coordenadores de áreas específicas, pós-graduação, estágio, egresso e de biblioteca.